金针菇子实体一般比较小,多数成束生长,肉质柔软有弹性;菌盖呈球形或扁半球形,直径1.5-7cm,菌盖表面有胶质薄层,湿时有粘性,色白至黄褐;菌肉白色,中央厚,边缘薄,菌褶白色或象牙色,较稀疏,长短不一,与菌柄离生或弯生;菌柄中生,长3.5-15cm,直径0.3-1.5cm,白色或淡褐色,空心。
担孢子生于菌褶子实层上,孢子椭圆形或梨核形(5.5-8×3.5-4.2μm),无色,光滑。金针菇富含蛋白质,还含有VB1、VB2、VC等多种维生素,且富含钙、磷、铁等多种矿物质,营养十分丰富。金针菇中还含有18种氨基酸,每100g鲜菇中含有8种的人体必需的氨基酸,占总氨基酸量的42.29%~51.17%,在氨基酸中精氨酸和赖氨酸含量较高,高于一般菇类。金针菇还含有独特功效的功能成分,如有多种药理作用的蛋白,有抗癌作用的多糖等,这些成分使得金针菇更加有价值。